УДК 577.212.063.8:578.832.1(574)
А.С. Муталиева¹, Г.Е. Нусупбаева¹, А.Б. Комиссаров², Д.М. Амандосова¹,
Н.Ж. Тлеумбетова¹, А.Ж. Кулжабаева^1
1Национальная референс-лаборатория по контролю за вирусными инфекциями
РГП на ПХВ «Научно-практический центр санитарно-эпидемиологической экспертизы
и мониторинга» КЗПП МНЭ РК, г. Алматы, Казахстан,
²Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт гриппа»
Министерства здравоохранения России, г. Санкт-Петербург, Россия

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ЭПИДЕМИЧЕСКИХ ШТАММОВ ВИРУСОВ ГРИППА А/H3N2 И В, ВЫДЕЛЕННЫХ В ЭПИДЕМИЧЕСКИЙ СЕЗОН 2014-2015 ГГ. НА ТЕРРИТОРИИ РЕСПУБЛИКИ КАЗАХСТАН

Внедрение молекулярно-генетических методов (секвенирование) изучения вирусов гриппа в лабораторную практику позволяет производить эффективный мониторинг циркулирующих вирусов, прогнозировать эффективность вакцинопрофилактики и лечения с помощью этиотропных препаратов. С этой целью нами были проанализированы последовательности гена гемагглютинина (НА) 4-х штаммов вируса гриппа А/H3N2 и 5-и штаммов вируса гриппа В Ямагатской линии.

Материал и методы. В работе были использованы эпидемические штаммы вируса гриппа А/H3N2(A/Semey/164/2015, A/Taraz/161/2015, А/Taraz/169/2014, A/Taraz/170/2014) и В (B/Uralsk/155/2015, B/Uralsk/156/2015, B/Karaganda/157/2015, B/Petropavlovsk/158/2015, Karaganda/159/2015), выделенных в эпидемический сезон 2014/2015 гг. Проведены капиллярное секвенирование полноразмерных последовательностей гемагглютинина вирусов гриппа с помощью автоматического генетического анализатора ABI GA3500 (Applied Biosystems, США) и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей и анализ соответствующих им аминокислотных последовательностей генов НА.
Результаты и обсуждение. В данной работе представлены результаты молекулярно-генетического анализа штаммов вируса гриппа А/H3N2 и В, выделенных в эпидемический сезон 2014/2015 гг. на территории РК. Молекулярно-генетический анализ показал, что эволюционная изменчивость вируса гриппа А/H3N2 и В сопровождалась последовательной сменой генетических клайдов и аминокислотными заменами в НА, которые повлияли на антигенные свойства штаммов. Определены специфические замены в НА (A/H3N2-S124N, R261Q, K264E, A530G, S159F, A212S, I230K; B-V558I) казахстанских штаммов, которые не встречались у штаммов, циркулировавших в других странах мира.
Выводы. Было установлено, что все исследованные штаммы вируса гриппа А/H3N2 и В значительно отличались от вакцинного штамма, рекомендованного Всемирной организацией здравоохранения на 2014-2015 гг. для северного полушария. В то же время все исследованные штаммы по принадлежности к генетическим клайдам и группам соответствуют рекомендациям ВОЗ по составу гриппозных вакцин на 2015-2016 гг. для северного полушария. Нуклеотидные последовательности генов, кодирующих НА вирусов гриппа А/H3N2 и В, были депонированы в международную базу данных EpiFlu GISAID.
Ключевые слова: эпидемические штаммы вируса гриппа А и В, гемагглютинин, секвенирование, молекулярно-генетический анализ.

 

Скачать